中国医科大学的口腔医学研究生教育始于1981年，为当时国务院批准的全国首批口腔临床医学硕士学位授权学科单位；1998年，口腔医学院获得口腔基础医学硕士学位授予权；2000年，获得口腔临床医学博士学位授予权，成为当时全国具有该资格的7所高等院校之一；2000年，作为全国首批试点，获得口腔临床医学硕士专业学位授予权；2009年，获得口腔临床医学博士专业学位授予权；2010年，获得口腔医学一级学科博士学位授予权。

中国医科大学口腔医学院研究生招生专业包括口腔临床医学和口腔基础医学，下设口腔颌面外科学、牙周病学、牙体牙髓病学、口腔黏膜病学、口腔修复学、口腔正畸学、口腔种植学、儿童口腔医学、口腔预防医学、口腔颌面影像诊断学、口腔解剖生理学、口腔组织病理学、口腔生物学、口腔材料学等三级学科，以及整形外科学、麻醉学等相关学科。全院现有博士生导师19人，硕士生导师67人，参编全国高等学校研究生规划教材4部（《正颌外科学》、《口腔颌面创伤外科学》、《牙周病学》、《口腔修复学》）。口腔医学研究生教育开展30年来，共培养博士202人，硕士（含七年制）1274人，为社会培养大量优秀的口腔医学高级专业人才。

口腔医学专业研究生由中国医科大学统一招生录取，由口腔医学院科研与学科建设部和各教研室负责研究生管理、培养等工作。科研与学科建设部负责研究生的就业指导、党团活动、常规管理等工作。

学院积极鼓励研究生开展科学研究与创业实践，其中，研究生团队在第十三届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛中荣获全国金奖。